Une étape importante pour l'art brassicole allemand, qui dès sa création a cherché à garantir la qualité de ses bières. En 1516, le duc Guillaume IV de Bavière a promulgué l'Ordonnance de pureté bavaroise. Seuls l'orge, le houblon et l'eau pourront désormais entrer dans la composition des bières bavaroises. Cette ordonnance a fondé la réputation mondiale de la bière bavaroise et donc aussi de la bière de Weihenstephan.

En 1803 le monastère de Weihenstephan est « sécularisé » par le Land de Bavière

Le 24 mars 1803 : le land de Bavière dissout le monastère de Weihenstephan. Dans le cadre de la sécularisation, tous les biens et droits du monastère ont été transférés à l'État bavarois. Après avoir résistés aux incendies, aux épidémies et aux catastrophes naturelles durant 1000 ans le monastère de Weihenstephan ne survit pas à la sécularisation.

Fort heureusement la brasserie continue de brasser de la bière allemande sous la direction du domaine royal de Schleißheim.

Les bâtiments du monastère sont transformés en 1852 en un centre international de formation à la technologie de brassage

L'école centrale d'agriculture de Schleißheim a déménagé dans les anciens murs du monastère de Weihenstephan.En 1919, une école supérieure d'agriculture et de brasserie, pour être absorbée en 1930 par l'université technique de Munich. Weihenstephan est ainsi devenue le « centre mondial de la technologie brassicole » ce qui a contribué à l'excellente réputation et à la renommée de la Bayerische Staatsbrauerei Weihenstephan. La plus vieille brasserie du monde a su faire face aux épreuves et se moderniser tout au long de ses bientôt 1000 ans d’histoire. L’alliance unique de la tradition et des technologies les plus modernes sont le fondement de l’identité incomparable et de la qualité des bières Weihenstephan.